Latin istilasından sonra tekrar inşa edilen ve iki binadan oluşan kilisenin büyük olanı Pammakaristos 13. yüzyılda, küçük olanı Parekklesion ise 14. yüzyıl başlarında yapılmıştır. III. Murad döneminde camiye çevrilen yapının bugün büyük olanı cami, küçük olanı ise müze olarak hizmet vermektedir.
